民国11年（1922年）4月，第一次直奉战争爆发，万福麟负责后方防守，为预备队。5月，奉军败还。不久，万福麟受任东北陆军第十五混成旅旅长，驻防满洲里。

两年后，第二次直奉战争爆发，在争夺山海关（榆关）的战斗中，万福麟亲临前线督战，为夺得热河战略要地立了功，以是升任东北陆军第十七师师长兼骑兵副军长。民国15年（1926年）初，万福麟因在平定郭松龄倒戈反奉中有功，又晋升为第八军军长，并被授予陆军中将、骁威将军等职衔．

民国17年（1928年）7月，任黑龙江保安副司令。张作霖、吴俊升在日本帝国主义制造的皇姑屯事件中丧生后，万福鳞继任黑龙江军务督办。同年12月底，东北易帜，他被南京国民政府委任为东北边防军副总司令。次年2月，国民政府任命万福麟为东北边防军副司令兼黑龙江省政府主席。

民国19年（1930）年夏，蒋介石和阎锡山、冯玉祥等之间的中原大战爆发，万福麟奉命率部进驻华北。翌年夏，他又奉命出兵击溃石友三的叛乱。后因张学良在北平患病，他被留在张之身边佐理军务。迄“九一八”事变爆发，未能回省主持军政。此后，即滞留北平。

万福麟在黑龙江任职期间，政绩无多，其人平庸寡能，处理省政少于思虑。富裕、德都设治均因不明治理而导致剧烈纷争，影响很大。在中东路事件中，因不明国际形势和苏联实力，轻率地派其精锐陈兵设防，边衅一开，首战梁中甲被俘，再战韩光第阵亡。军事失利，民怨四起。继之，又不经调查，即将受省城群众团体推举赴沈阳请求增援的刘风池（薇伯）处决，从而引起公愤。

但他也办了一些好事。如给贫民博济工厂、孤儿院增加经费，修造贫困工人宿舍，拨款整顿中、小学等，而更主要的是监修《黑龙江志稿》，和修建图书馆。黑龙江地方志的纂修，动议于光绪二十二年（1896年），其后因故时修时辍，迄未成书。

万福麟到江后，即聘张伯英为总纂，自任监修，筹措经费设立机构，至民国21年（1932年）全书告成，定名为《黑龙江志稿》。翌年，由万福麟个人出资在北平印刷公之于世，评者谓是书为研究黑龙江及东北地区（也包含齐齐哈尔）政治、经济，文化的重要典籍。

黑龙江图书馆建立虽早，但馆舍狭窄，不便使用。图书馆馆长于德辅曾向当局多次提出修建新馆的建议。万福鳞莅任后鉴于馆舍局促，设备简陋，地址不适等情况，乃于民国19年（1930年）春，召开政府会议，决定筹建新馆舍，并责成省教育厅长高家骥，省政府参议张庆琦、省政府秘书长汪维城等人负责筹建。新馆工程于同年4月开工至10月竣工使用。

这是他办的两件遗惠后世的善举。

东北沦陷后，万福麟于民国21年（1932年）9月，被委任新编第四军军长。10月，奉张学良之命由喜峰口进入热河，驻扎平泉县。翌年初，日本侵略军进逼热河，万福麟指挥东北军5个旅、3个炮兵团参加作战。因汤玉麟抵抗不力，使万部腹背受敌而从喜峰口撤出。旬日间，热河便被日军侵占。

热河之战失利，东北军一时声誉扫地，张学良引咎辞职．万于热河败绩后，参加了同年7月对方振武、吉鸿昌所部抗日同盟军的围攻，受到军事委员会北平分会代委员长何应钦的赏识，并委任他为军事委员会北平分会副主任。至民国24年（1935年）又任冀察政务委员会委员，获二级陆军上将军衔。

七七事变后，国民党重新编组军队，万福麟受任第一集团军副总司令兼第五十三军军长，负责平汉线以北永定河及大清河一线的防守。在日本侵略军的猛烈攻击下，万部损失惨重，被迫退出战场，孤军游击于太行山区。

民国28年（1939年）2月，万重整部队，参加豫北、豫东的对日作战。6月，武汉会战开始，万福麟任第二十六军团军团长兼第五十三军军长，负责防守德安、星子一线。9月，在鄂东南大冶、阳新一线抗击来犯日军精锐，苦战数日，敌人受到重创，其本部亦伤亡惨重损失很大。武汉会战失败，第五十三军奉命休整补充，万福麟调赴重庆任国民政府军事委员会委员，军长职务由周福成接任。

抗战胜利后，万福麟一度被派任东北行辕副主任、东北行营政务委员会主任。不数月，东北解放。民国38年（1949年），万即随国民党政府转赴台湾，任国民党政治咨询委员会委员。1951年7月，病逝于台中，终年71岁。

儿子：万国权（1919.3—2017），男，汉族，1919年3月生，中华大学工商管理系毕业，大学文化。吉林农安人。民建成员。